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科研服務(wù)

全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

派森諾特色分析內(nèi)容舉例

可變剪切模型可視化


上圖左下角和右下角的數(shù)字分別代表該基因的起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。該圖一共分4行,第一行為以該基因的注釋文件作出的基因模型,第二行為根據(jù)測(cè)序結(jié)果與注釋文件共同作出的基因模型,第三行也是根據(jù)測(cè)序結(jié)果與注釋文件共同作出的基因模型,與第二行不同的是只是畫(huà)出isoform,第四行則是測(cè)序文件中支持各外顯子的reads數(shù)目。灰色的五邊形代表外顯子,它們之間的連線表示不同的剪接方式。紫色背景表示有外顯子出現(xiàn)的區(qū)域(這其中包括保留的內(nèi)含子),白色背景表示沒(méi)有外顯子出現(xiàn)的區(qū)域(即內(nèi)含子區(qū)域)。圖中白色背景的寬度并不代表真實(shí)的內(nèi)含子長(zhǎng)度,由于有的基因內(nèi)含子區(qū)域遠(yuǎn)比外顯子區(qū)域長(zhǎng),為了更清楚地展示可變剪切模型,內(nèi)含子區(qū)域會(huì)被縮短很多。

融合基因染色體分布


內(nèi)圈以連線的形式展示了融合基因的兩個(gè)組成基因在染色體上的分布位置,外圈則以散點(diǎn)圖的形式展示了各位點(diǎn)上的基因成為多少種融合基因的組成成分的情況。


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