国产青榴社区91精品,久久成人精品免费播放,久久精品人人做人人试看

首頁>科研服務>三代測序服務>三代測序服務>全長轉錄組測序

科研服務

全長轉錄組測序

常見問題

  • 1. PacBio測序平臺的技術原理?                                    

    利用 PacBio RS II/Sequel 進行全長轉錄組測序,平臺包含 16 個測序模塊(SMRT cell),每個 SMRT cell 包含 15 萬/100萬個測序單元(零模波導孔,ZMWs)。需要將 mRNA 進行反轉錄并進行環化處理,形成 CCS,每個 ZMW(零模波導孔)將容納 1 個 CCS 分子。由于全長轉錄組測序對 mRNA 不進行打斷,直接進行上機測序,而每個 CCS 的片段長度不同,較小的 CCS 會先落入 ZMWs 中,而導致長片段很難測到。因此,在文庫構建時,需要將 mRNA 根據長度分成不同的段,分別構建文庫和測序。                                    

  •  2. PacBio測序平臺測序方案有什么推薦?                                    

    對樣本進行分段處理,構建不同片段長度的文庫,我們推薦每個樣本構建3-6個文庫。 建議8-15G subreads。                                    

  • 3. 全長轉錄組測序分析內容包括哪些?                                    

    分析內容包括:轉錄本覆蓋度計算、轉錄本功能注釋、轉錄本GO 分類注釋、轉錄本 eggNOG分類注釋、轉錄本KEGG分類注釋、ORF分析、可變剪接分析等。                                    

主站蜘蛛池模板: 台中县| 华容县| 阜康市| 两当县| 靖西县| 延长县| 定兴县| 林芝县| 博爱县| 托克逊县| 南溪县| 黔东| 屯留县| 绍兴县| 望江县| 萍乡市| 鄂尔多斯市| 枣阳市| 中方县| 峡江县| 安义县| 津南区| 博湖县| 如皋市| 郎溪县| 玉环县| 遂溪县| 新巴尔虎左旗| 甘南县| 鹤岗市| 云林县| 丰镇市| 普兰县| 彭阳县| 商河县| 历史| 寿阳县| 镇雄县| 宜兴市| 新晃| 五台县|