一、數據質量
NextSeq下機數據R1端堿基質量分布圖
NextSeq下機數據R2端堿基質量分布圖
NextSeq測試數據質量表格
?從以上數據圖表可以發現,NextSeq_PE300結果數據質量更高,堿基質量Q30平均可以達到90%左右,遠遠高出官方提供標準,數據利用率也會大幅提升;
二、數據分析結果展示
NovaSeq與NextSeq——門和屬水平物種相對豐度柱形圖
MiSeq與NextSeq——門和屬水平物種相對豐度柱形圖
?無論是門水平還是屬水平物種組成分析結果,都可以看出,幾種測序平臺得到的物種組成及豐度分布保持高度一致,優勢物種分布無差別;
NovaSeq與NextSeq——Alpha多樣性分析結果
MiSeq與NextSeq——Alpha多樣性分析結果
?Alpha多樣性分析結果顯示,幾種測序平臺間樣品內微生物的豐度程度及多樣性程度基本一致;
NovaSeq與NextSeq——Beta多樣性分析結果
MiSeq與NextSeq——Beta多樣性分析結果
?同時,Beta多樣性分析結果顯示,幾種測序平臺的同一樣品物種組成及豐度分布基本一致,且高度相關。
上述結果表明,作為Illumina測序系統中的擁有長度長模式的“新貴”,NextSeq平臺不僅能獲得和NovaSeq與MiSeq平臺高度一致的菌群組成結構,而且在測序質量上,也相比Q30>70%的MiSeq PE300模式官方質控標準,有了大幅提升!更重要的是,NextSeq的測序通量至少是MiSeq平臺的4倍以上,能輕而易舉的實現大樣品量、高測序量的長片段樣品,對于低豐度物種的探測、以及菌群整體組成的分辨率也將更精細!