菌群組成譜全長(zhǎng)測(cè)序研究
基于PacBio三代測(cè)序平臺(tái),能夠讀取群落微生態(tài)系統(tǒng)中微生物的rRNA基因/ITS全長(zhǎng)序列,不受制于短序列的局限性,并確保全長(zhǎng)序列的測(cè)序,從而在種甚至菌株等精細(xì)水平,解析菌群多樣性和組成譜。
產(chǎn)品特色
l 深入獲取微生物群落的精細(xì)組成信息;
l 預(yù)測(cè)微生物群落的潛在代謝功能,并指導(dǎo)后續(xù)宏基因組測(cè)序研究;
l 通過(guò)“全微生物組關(guān)聯(lián)研究(Microbiome-Wide Association Studies,MWAS)”,鑒定與表型/組間差異相關(guān)的關(guān)鍵物種。
應(yīng)用領(lǐng)域
l 微生物組與環(huán)境互作關(guān)系的研究;
l 微生物組與宿主共生關(guān)系的研究;
l 微生物組在臨床醫(yī)學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用;
l 微生物組在發(fā)酵工藝、食品加工/檢測(cè)等行業(yè)的應(yīng)用。
派森諾優(yōu)勢(shì)
l 自動(dòng)化、完善的DNA提取擴(kuò)增體系和樣本前處理流程;
l 派森諾擁有PacBio RSII和Sequel兩種單分子實(shí)時(shí)測(cè)序平臺(tái),提供測(cè)序服務(wù);
l Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等多個(gè)物種注釋數(shù)據(jù)庫(kù),優(yōu)化物種的分類鑒定;
l 專家教授多方位支持,可按需個(gè)性化定制;
l 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,涵蓋水樣、活性污泥、土壤、排泄物、體液、組織等各類樣本。
PacBio和Illumina平臺(tái)對(duì)菌群16S rRNA基因測(cè)序結(jié)果的比較,并改善物種分類信息的不確定性。
派森諾菌群組成譜全長(zhǎng)測(cè)序分析流程