全基因組關聯分析(Genome-wide association study,GWAS)是一種在某一特定群體中研究遺傳突變和表型之間的相關性的方法。通過對遺傳多樣性豐富的自然群體中的個體進行測序,結合準確的目標性狀的表型數據及統(tǒng)計方法進行全基因組分子標記與性狀之間的關聯分析,可對動植物復雜性狀進行定位,快速獲得影響目標性狀表型變異的遺傳標記或候選基因。
產品參數
基于重測序 | 基于簡化測序 | |
測序平臺 | Illumina Novaseq | |
打斷方式 | 物理打斷 | 雙酶切打斷,片段220-450bp |
測序深度 | ≥5×/樣本 | ≥2×/樣本 |
文庫類型 | PE 300~500bp(推薦) | dd-RAD文庫 |
樣本選擇 | 無明顯亞群分化的自然群體,個體數不少于200個 | |
DNA樣本量 | 總量≥0.5 μg,濃度≥10 ng/μl (單個樣本) | 總量≥0.5 μg,濃度≥10 ng/μl (總樣本) |
適用范圍 | 有參考基因組物種 | 參考基因組較大的物種 |
項目周期 | 標準分析40天 |