基于PacBio三代測序平臺的全長轉(zhuǎn)錄組測序(Iso-Seq),可直接獲得mRNA的全長序列,可更為準(zhǔn)確地解讀mRNA的結(jié)構(gòu)信息。通過全長轉(zhuǎn)錄組測序,可克服無參考基因組物種轉(zhuǎn)錄本拼接短、信息不完整的難題,獲取全長mRNA序列,實現(xiàn)同源異構(gòu)體分析,單堿基變異檢測, 可變剪接分析,同源基因識別及等位基因識別。
全長轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計思路可以是單個樣品進(jìn)行測序,與參考基因組進(jìn)行比較進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析,亦可以對多個樣品進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)方面的差異比較分析。