細菌全基因組完成圖測序
細菌完成圖測序是指對基因組序列未知或無近緣物種基因組信息的某個物種,構建不同插入片段的基因組文庫,基于 PacBio三代單分子測序技術結合二代高通量測序技術,對這些文庫進行序列測定,利用生物信息學方法進行拼接,獲得完整的染色體及質粒序列,解析編碼信息和表觀遺傳修飾信息。
應用領域
l 獲得完整的染色體序列圖譜
l 獲得完整的質粒或 BAC 克隆子序列圖譜
l 解析甲基化修飾相關信息(6mA和4mC)
派森諾優勢
(1) 項目周期短:完成圖項目周期 15 工作日,平均項目周期 30 工作日;
(2) 方案設計合理:完成圖的方案以三代平臺為主、二代平臺為輔,得到完整的染色體和質粒序列圖譜;
(3) 免費贈送待測菌株的菌種鑒定,以防菌株錯測;
(4) 拼接結果準確:三輪校正(拼接前利用三代測序數據間的 Overlap 對測序數據進行校正;拼接后,利用三代測序數據對拼接結果進行第二輪校正;最后,利用高質量的二代測序數據對拼接結果進行多次校正)使得到的基因組拼接結果更加準確;
(5) 項目經驗豐富:細菌完成圖已完成樣品數量近 300 例;
(6) 細節服務到位:無論是圈圖起始位點的調整,還是起始密碼子的翻譯(起始密碼子的氨基酸均為甲硫氨酸),力求做到滿意。