菌群組成譜全長測序研究
基于PacBio三代測序平臺,能夠讀取群落微生態系統中微生物的rRNA基因/ITS全長序列,不受制于短序列的局限性,并確保全長序列的測序,從而在種甚至菌株等精細水平,解析菌群多樣性和組成譜。
產品特色
l 深入獲取微生物群落的精細組成信息;
l 預測微生物群落的潛在代謝功能,并指導后續宏基因組測序研究;
l 通過“全微生物組關聯研究(Microbiome-Wide Association Studies,MWAS)”,鑒定與表型/組間差異相關的關鍵物種。
應用領域
l 微生物組與環境互作關系的研究;
l 微生物組與宿主共生關系的研究;
l 微生物組在臨床醫學和精準醫療領域的應用;
l 微生物組在發酵工藝、食品加工/檢測等行業的應用。
派森諾優勢
l 自動化、完善的DNA提取擴增體系和樣本前處理流程;
l 派森諾擁有PacBio RSII和Sequel兩種單分子實時測序平臺,提供測序服務;
l Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等多個物種注釋數據庫,優化物種的分類鑒定;
l 專家教授多方位支持,可按需個性化定制;
l 項目經驗豐富,涵蓋水樣、活性污泥、土壤、排泄物、體液、組織等各類樣本。
PacBio和Illumina平臺對菌群16S rRNA基因測序結果的比較,并改善物種分類信息的不確定性。
派森諾菌群組成譜全長測序分析流程