病毒(Virus)由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(zhì)(Protein)構(gòu)成或由蛋白質(zhì)構(gòu)成(如 朊病毒)。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成,可分為單鏈 DNA 病毒(ssDNA)、雙鏈 DNA 病毒(dsDNA)、單鏈 RNA 病毒(ssRNA)、雙鏈 RNA 病毒(dsRNA)和蛋白質(zhì)病毒(如朊病毒)。根據(jù)宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細(xì)菌病毒)、植物病毒(煙草花葉病毒)和動物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。
病毒全基因組測序(Virus Whole Genome Sequencing,VWGS),是指基于二代高通量測序技術(shù),對病毒全基因組進(jìn)行測序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應(yīng)的變異信息。
產(chǎn)品參數(shù)
產(chǎn) 品 | 文庫插入片段大小(bp) | 測序平臺及測序模式 | 測序深度 | 交付指標(biāo) | 項目周期 |
1 痕量單鏈RNA病毒測序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 30 個自然日 |
痕量單鏈RNA病毒測序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 40 個自然日 |
常規(guī)單鏈RNA病毒測序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 30 個自然日 |
常規(guī)單鏈RNA病毒測序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 40 個自然日 |
常規(guī)雙鏈DNA病毒測序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 30 個自然日 |
常規(guī)雙鏈DNA病毒測序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 數(shù)據(jù)量 | 40 個自然日 |
* 測序深度:推薦的測序深度指目標(biāo)病毒基因組的測序深度,具體測序數(shù)據(jù)量計算參見“病毒基因組測序數(shù)據(jù)量估算”;
1 痕量病毒:指核酸量在10 ng~200 ng的病毒樣品
樣品要求
*病毒類樣本不接受原樣送樣,只接收核算樣品,及DNA病毒僅接受提取好的雙鏈DNA,RNA病毒僅接受反轉(zhuǎn)錄好的雙鏈cDNA。