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宏基因組測序

宏基因組測序研究

        宏基因組學(Metagenomics)研究通過全基因組鳥槍法(Whole  Genome Shotgun,WGS)測序策略,將提取獲得的微生物組總DNA隨機打斷為短片段,并構建合適長度的插入片段文庫,對這些文庫進行雙端(Paired-end,PE)高通量測序,從而能精細地展示整個菌群的功能代謝譜和物種精細組成譜,進而在組成和功能水平分別挖掘關鍵生物

標記物,從原理上闡明微生物群落在生態系統中發揮作用的根本機制。

宏基因組測序項目流程

微生物組總DNA提取→DNA片段化→連接接頭序列→純化、富集DNA片段→測序文庫定量→上機進行高通量測序→生信分析

宏基因組測序產品特點

1、直接對群落樣本中的基因片段進行測序,真實再現群落復雜而精密的生態功能;

2、樣本類型涵蓋各類生境,微量提取成功率高;

3、使用Illumina NovaSeq超高通量測序平臺,速度更快周期更短;

4、功能+物種,雙管齊下;拼接+不拼接,各取所長,實現對物種和功能的“高分辨率”定量;

5、根據樣本、數據特征,自動選擇分析流程,多種功能注釋數據庫可選,優化宏基因組功能代謝譜注釋;

6、通過多種多變量統計分析和機器學習方法,系統、深入地挖掘宏基因組大數據中差異相關的關鍵物種和關鍵功能,識別關鍵生物標記物。



宏基因組測序1.jpg


宏基因組測序2.jpg




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