BSA(Bulked Segregant Analysis):稱為混合分組分析法,是一種利用極端性狀進(jìn)行功能基因定位的一種方法。主要是將兩組具有極端性狀的群體進(jìn)行混池測序,比較兩組群體在多態(tài)位點(SNP)的等位基因頻率(AF)是否具有顯著差異,即而將目標(biāo)性狀基因定位在染色體區(qū)段上。
自然突變基因定位:QTLseq
人工誘變基因定位:Mut Map
產(chǎn)品參數(shù)
研究類型 | 樣本選取 | 測序平臺 | 測序深度 | 項目周期 |
QTL | 親本:2個極端表型親本 子代:極端表型個體混池, 每個池至少20個個體 | Illumina Novaseq PE400, 150*2 | 親本 ~20× 子代混池 ~30× | 35天 |
MutMap | 親本:1個野生型表型親本子代:極端表型個體混池, 每個池至少20個個體 | 親本 ~20× 子代混池 ~30× |