CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白質-DNA互作關系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技術,適用于無ChIP級別抗體的蛋白研究。與傳統的ChIP-Seq研究方法相比,該技術無需交聯、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作,因此具有省時高效、所需的樣品量少、背景信號低和可重復性好等優點,甚至可用于單細胞水平測序。CUT&Tag有望將蛋白質-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應的常規操作,對基因調控、表觀遺傳等領域的研究具有革命性的意義。
技術原理:CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技術,該技術利用一抗靶向結合目的蛋白,二抗孵育放大信號,創新性的pA-Tn5融合蛋白與一抗和二抗中的Fc區結合,Mg2+激活pA-Tn5的Tn5酶活性后切割目標區域并加上接頭,經PCR擴增就可獲得目標蛋白結合區域的文庫。簡化建庫操作,提高了信噪比,實現了低細胞量樣本研究組蛋白修飾和轉錄因子的目標。
推薦平臺:Novaseq 6000 PE150
生物信息分析
1.原始數據整理、過濾及質量評估
2.與參考基因組序列比對
3.Peak Calling(統計每個樣品的Peak片段信息)
4.基因附近及Peak中心信號分布圖
5.Peak序列Motif及注釋分析
6.Peak鄰近基因功能分析
7.差異Peak序列Motif及注釋分析
8.差異Peak鄰近基因功能分析
9.Overlap基因功能分析
派森諾的優勢
1.根據實際需求可個性化定制測序及分析方案。
2.嚴謹的實驗流程和檢測結果,數據分析結果可信。
3.分析結果的圖表參考國際期刊設計,可直接用于文章寫作。
4.與轉錄組等數據進行聯合分析,挖掘生物信息資源。