擴增子/功能基因測序借助合適的類群特異性引物,可以檢測菌群中特定種類/功能微生物的特征序列,反映菌群中該特定類群微生物的組成結構,從而發現它們的分布特征,闡明樣本間多樣性和組成差異,進而揭示該類群微生物中與差異相關聯的關鍵成員。
項目流程
微生物組總DNA提取→目標片段PCR擴增→擴增產物檢測定量→測序文庫制備→上機進行高通量測序 →生信分析
產品特點
對特定種類/功能的微生物群落進行研究,比如產甲烷微生物、硝化/反硝化微生物等特定的微生物類群等,好比拿了一把“放大鏡”,而消除了其它不相干微生物類群的干擾。
實驗經驗豐富:
樣本類型全。涵蓋動植物、土壤、水體等各類生境;
基因種類多。涵蓋碳氮磷硫代謝、線粒體、葉綠體、重金屬抗性等;
派森諾分析深入:
FrameBot校正。糾正移碼錯誤,去除非目的序列;BROCC注釋算法。替代BLAST,確保“真陽性”;NCBI-nt/nr數據庫、功能基因限定參考子集。