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菌群多樣性組成譜全長測序

派森諾特色分析內容舉例


種水平的精細組成圖


上圖中,橫坐標依據樣本名排列,每一個柱形圖代表一個樣本,并以顏色區分各分類單元,縱坐標代表各分類單元的相對豐度,柱子越長,該分類單元在對應樣本中的相對豐度越高。


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組間差異顯著的種水平分類單元的豐度分布小提琴圖


上圖中,橫坐標為組間差異顯著的種水平分類單元,縱坐標為各分類單元在各樣本(組)內的序列量,以小提琴圖結合箱線圖的形式展示:其中,小提琴圖可以直觀地顯示數據的分布特征,“小提琴”的“胖瘦”反映了樣本數據分布的密度高低(寬度越寬,表明該序列量水平所對應的樣本越多);箱線圖邊框代表上下四分位數間距(Interquartile range,IQR),橫線代表中位值,上下觸須分別代表上下四分位以外的1.5倍IQR范圍,符號“?”表示超過范圍的極端值。

種水平關聯網絡分析圖


上圖中,各節點的圓圈代表種水平的各分類單元,以不同的顏色標識,節點之間的連接表明兩個物種之間存在相關性,紅線表明正相關,綠線表明負相關。通過某節點的連接越多,表明該物種與菌群中其它成員的關聯越密切。


菌群代謝功能預測的KEGG直系同源基因簇(KO)豐度熱圖


上圖中,樣本先按照彼此之間功能類群豐度分布的相似度進行聚類,根據聚類結果橫向依次排列。同理,功能類群也按照彼此在不同樣本中分布的相似度進行聚類,根據聚類結果縱向依次排列。圖中,紅色代表在對應樣本中豐度較高的功能類群,綠色代表豐度較低的功能類群。


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