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科研服務(wù)

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序分析內(nèi)容


序號

分析項目

類別

分析

備注

1

原始數(shù)據(jù)整理

A


2

數(shù)據(jù)質(zhì)控

A


3

高質(zhì)量序列獲取

A


4

轉(zhuǎn)錄本拼裝及分析

A


5

Unigene 聚類

A


6

Unigene 功能注釋

A


7

Unigene GO 分類注釋

A


8

Unigene eggNOG分類注釋

A


9

Unigene KEGG分類注釋

A


10

Unigene 表達量計算

A


11

Unigene表達量密度分布

A


12

Unigene測序飽和度分析

A


13

Unigene覆蓋均一度分析

A


14

樣品相關(guān)性檢測

A

需要有生物學(xué)重復(fù)

15

表達差異 Unigene 檢測(兩兩樣品間

A

提供分組信息

16

表達差異 Unigene GO富集分析

A


17

表達差異 Unigene GOSlim富集分析

A


18

表達差異 Unigene KEGG富集分析

A


19

表達差異 Unigene 聚類分析

A

樣品數(shù) ≥ 3

20

主成分分析

A


21

cSNP 分析

A


22

InDel 分析

A


23

SSR 分析

A


24

ORF 分析

A


25

組間共有特有差異基因可視化

B


實驗分組 ≥ 3

26

蛋白網(wǎng)絡(luò)互作分析

B


27

轉(zhuǎn)錄因子分析

B


默認做植物物種

28

共表達網(wǎng)絡(luò)分析

B


樣品數(shù) ≥ 20

29

共有差異表達基因分析

B

提供分組信息



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序分析結(jié)果展示

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序2.png

圖1  NR注釋統(tǒng)計 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序3.png

圖2  KEGG注釋 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序4.png

圖3  差異表達基因聚類 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序5.png

圖4  SNP 和 InDel 統(tǒng)計

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