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首頁>科研服務(wù)>轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白代謝組學(xué)>轉(zhuǎn)錄組>真核無參轉(zhuǎn)錄組測序

科研服務(wù)

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序分析內(nèi)容


序號

分析項目

類別

分析

備注

1

原始數(shù)據(jù)整理

A

√


2

數(shù)據(jù)質(zhì)控

A

√


3

高質(zhì)量序列獲取

A

√


4

轉(zhuǎn)錄本拼裝及分析

A

√


5

Unigene 聚類

A

√


6

Unigene 功能注釋

A

√


7

Unigene GO 分類注釋

A

√


8

Unigene eggNOG分類注釋

A

√


9

Unigene KEGG分類注釋

A

√


10

Unigene 表達量計算

A

√


11

Unigene表達量密度分布

A

√


12

Unigene測序飽和度分析

A

√


13

Unigene覆蓋均一度分析

A

√


14

樣品相關(guān)性檢測

A

√

需要有生物學(xué)重復(fù)

15

表達差異 Unigene 檢測（兩兩樣品間）

A

√

提供分組信息

16

表達差異 Unigene GO富集分析

A

√


17

表達差異 Unigene GOSlim富集分析

A

√


18

表達差異 Unigene KEGG富集分析

A

√


19

表達差異 Unigene 聚類分析

A

√

樣品數(shù) ≥ 3

20

主成分分析

A

√


21

cSNP 分析

A

√


22

InDel 分析

A

√


23

SSR 分析

A

√


24

ORF 分析

A

√


25

組間共有特有差異基因可視化

B


實驗分組 ≥ 3

26

蛋白網(wǎng)絡(luò)互作分析

B

√


27

轉(zhuǎn)錄因子分析

B


默認做植物物種

28

共表達網(wǎng)絡(luò)分析

B


樣品數(shù) ≥ 20

29

共有差異表達基因分析

B

√

提供分組信息



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序分析結(jié)果展示

真核無參轉(zhuǎn)錄組測序2.png

圖1  NR注釋統(tǒng)計 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序3.png

圖2  KEGG注釋 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序4.png

圖3  差異表達基因聚類 



真核無參轉(zhuǎn)錄組測序5.png

圖4  SNP 和 InDel 統(tǒng)計




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