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科研服務

ATAC-seq

分析內容:

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分析結果展示:


Peak Calling

對 Peak 注釋分析結果中 Peak 在所覆蓋的基因的功能性區域上的分布進行統計,并使用 ChIPseeker 包將統計結果繪制成每個樣本分開查看的餅圖如下:


 

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Peak在功能元件上的分布


 

Peak 鄰近基因GO富集柱狀圖

挑選了Peak鄰近基因顯著富集的GO條目中的前20條繪制柱狀圖進行展示:

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Peak 鄰近基因 GO 富集柱狀圖


 

差異Peak鄰近基因Pathway富集柱狀圖和氣泡圖

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差異Peak鄰近基因Pathway富集氣泡圖


GO網絡圖分析

做完Pathway富集分析后,可能會得到幾百甚至幾千個富集到的Pathway條目, 為了有效的利用富集分析的結果,可以通過條目之間的關系找到處于更關鍵位置的Pathway條目:

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GO網絡圖


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