分析內容:
分析結果展示:
Peak Calling
對 Peak 注釋分析結果中 Peak 在所覆蓋的基因的功能性區域上的分布進行統計,并使用 ChIPseeker 包將統計結果繪制成每個樣本分開查看的餅圖如下:
Peak在功能元件上的分布
Peak 鄰近基因GO富集柱狀圖
挑選了Peak鄰近基因顯著富集的GO條目中的前20條繪制柱狀圖進行展示:
Peak 鄰近基因 GO 富集柱狀圖
差異Peak鄰近基因Pathway富集柱狀圖和氣泡圖
差異Peak鄰近基因Pathway富集氣泡圖
GO網絡圖分析
做完Pathway富集分析后,可能會得到幾百甚至幾千個富集到的Pathway條目, 為了有效的利用富集分析的結果,可以通過條目之間的關系找到處于更關鍵位置的Pathway條目:
GO網絡圖