1.ATAC-seq是否適合您?
ATAC能回答以下三個問題:
①找調(diào)控某一生物學(xué)過程的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子
②找哪個轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控了我感興趣的基因
③找我感興趣的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的靶基因
2.ATAC-seq與ChIP-seq異同點?
1.ATAC-Seq是在全基因組范圍內(nèi)檢測染色質(zhì)的開放區(qū)域,可以得到蛋白質(zhì)的潛在結(jié)合位點,不依賴于抗體,一般用于不知道特定的轉(zhuǎn)錄因子。
2.ChIP-Seq是明確知道感興趣的轉(zhuǎn)錄因子是什么,利用特異性抗體富集蛋白質(zhì)及其結(jié)合的DNA片段,從而驗證蛋白質(zhì)與DNA的相互作用關(guān)系。