Illumina NovaSeq X Plus
Illumina NovaSeq 6000
NextSeq? 2000
Illumina MiSeq
MGI DNBSEQ-T7
NextSeq? 500
PacBio Sequel II
PacBio Sequel
PacBio Revio
PromethION24
Chromium controller
Chromium X
Visium CytAssist
CytoFLEX SRT 細胞分選儀
Orbitrap Exploris? 120
Orbitrap Astral
timsTOF UItra
Q Exactive HF-X
分析內容及結果
聚類分析:兩個不同階段的腫瘤樣本變異位點的聚類分析,橫坐標代表不同的聚類群,縱坐標反應了等位基因的變異頻率,圖中標注的基因為驅動基因。上下兩個圖比較可看出腫瘤樣本的不同階段各個克隆群的變化情況。
蛋白互作網絡分析 候選基因GO富集分析
變異可視化分析
腫瘤亞克隆結構與進化分析
染色體拷貝數分布及等位基因變異頻率分析
染色體區域拷貝數變異分布