m6A甲基化常見修飾部位有哪些?
m6A傾向于分布在mRNA的蛋白質編碼序列(CDS)、3′非翻譯區(qū)(3′UTR)、終止密碼子附近、剪切位點附近以及長的外顯子區(qū)域,而且其修飾區(qū)域在人和鼠中具有很高的保守性;在microRNA靶位點及其鄰近區(qū)域也有m6A富集。
常見的m6A甲基化修飾類型
mRNA甲基化測序有何技術優(yōu)勢?
能夠直接對任意物種的轉錄組高甲基化片段進行測序,可無參。
能夠在實際結合位點100-200個堿基范圍內(nèi)定位。
覆蓋整個轉錄組范圍的甲基化區(qū)域。
直接對甲基化片段進行定量和測序,不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。