m6A甲基化常見修飾部位有哪些?
m6A傾向于分布在mRNA的蛋白質編碼序列(CDS)、3′非翻譯區(3′UTR)、終止密碼子附近、剪切位點附近以及長的外顯子區域,而且其修飾區域在人和鼠中具有很高的保守性;在microRNA靶位點及其鄰近區域也有m6A富集。
常見的m6A甲基化修飾類型
mRNA甲基化測序有何技術優勢?
能夠直接對任意物種的轉錄組高甲基化片段進行測序,可無參。
能夠在實際結合位點100-200個堿基范圍內定位。
覆蓋整個轉錄組范圍的甲基化區域。
直接對甲基化片段進行定量和測序,不存在傳統芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。