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科研服務(wù)

CircRNA測(cè)序

常見問(wèn)題

  • 為什么CircRNA測(cè)序的研究比較熱？

    1）多角度闡述分子生物學(xué)問(wèn)題的需要；

    2）從新的角度發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致樣本存在差異的需要；

    3）尋找影響疾病發(fā)生的分子標(biāo)記；

    4）探究circRNA的未知功能；

    5）尋找導(dǎo)致microRNA表達(dá)發(fā)生變化的機(jī)理。

  • CircRNA測(cè)序需要多少數(shù)據(jù)量？

    推薦10G clean data/樣本的數(shù)據(jù)量。

  • CircRNA測(cè)序的條件？

    1. 有參考基因組，并且有CircRNA注釋信息；

    2. 有相應(yīng)的核糖體去除試劑盒。

  • CircRNA有哪些特點(diǎn)？

    1. 大多存在于細(xì)胞質(zhì)中，且序列高度保守；

    2. 一般細(xì)胞或組織中，環(huán)狀RNA較穩(wěn)定，半衰期在48h，其他mRNA（線性）半衰期約為10h；血清中的外顯子環(huán)狀RNA不穩(wěn)定，半衰期<15s。

    3. 不同細(xì)胞中表達(dá)的環(huán)狀RNA可能不同；

    4. 同一個(gè)基因可能即產(chǎn)生線性mRNA，又可以轉(zhuǎn)錄成環(huán)狀RNA;

    5. 總量估計(jì)，外顯子環(huán)狀RNA（exonic ciRcRNA）的量約為polyA mRNA（線性mRNA）的1%；占非核糖體RNA的0.8%；

    6. 大部分為ncRNA。




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