細胞懸液的制備過程中是否會影響基因的表達?
目前常用的方法中,不管是酶消化還是機械操作都會不可避免的對細胞產生影響,前者會使細胞產生應激反應,后者則容易損傷細胞,進而影響細胞活性。所以,在單細胞測序實驗設計時,設置對照是非常重要的。前述的這些影響,在case和control中同樣存在,我們關注case和control的差異表達基因,就可以去除實驗的系統誤差,找到決定感興趣生物學過程的關鍵基因。
如何判斷細胞類型?
細胞類型的判斷是需要您自己選擇Marker基因的,您可以參考同類物種或樣本的已發表文章,或者根據數據庫去確定Marker,比如CellMarker,panglao等。
10XGenomics單細胞平臺有什么優勢?
一.細胞通量高,一次可捕獲上萬細胞 ;
二.對細胞大小及類型限制低,且捕獲效率達65% ;
三.從懸液到文庫構建周期短。