以Illumina 為代表的二代測(cè)序平臺(tái)，具有測(cè)序數(shù)據(jù)量大，成本低，可以為基因組測(cè)序提供高覆蓋率的數(shù)據(jù)的優(yōu)勢(shì)。但是該平臺(tái)存在讀長(zhǎng)短、具有 GC 偏好性等特點(diǎn)，難以跨過(guò)重復(fù)序列區(qū)域和高 GC 含量的區(qū)域。以PacBio 公司的RS II和Sequel 平臺(tái)為代表的三代測(cè)序平臺(tái)，具有讀長(zhǎng)長(zhǎng)（平均reads 長(zhǎng)度 > 10 kb）、測(cè)序速度快（運(yùn)行時(shí)間短，單個(gè)SMRT Cell的運(yùn)行時(shí)間為2~6 hour）、通量高（平均每個(gè) SMRT Cell 產(chǎn)生~8G有效數(shù)據(jù)）、無(wú) GC 偏好性、能檢測(cè)堿基修飾信息（包括甲基化修飾）、無(wú) PCR 偏向性（不需要經(jīng)過(guò) PCR 擴(kuò)增，避免測(cè)序覆蓋的不均一性）等特點(diǎn)，尤其適合動(dòng)植物基因組的從頭測(cè)序。根據(jù)物種基因組的特點(diǎn)及復(fù)雜程度，派森諾生物會(huì)科學(xué)地設(shè)計(jì)測(cè)序?qū)嶒?yàn)方案，合理地將多個(gè)平臺(tái)搭配在一起使用，既能解決復(fù)雜基因組的測(cè)序難題，保證基因組測(cè)序的質(zhì)量，同時(shí)也能兼顧實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的經(jīng)濟(jì)性。
