細(xì)菌全基因組從頭測序
細(xì)菌全基因組完成圖測序
細(xì)菌完成圖測序是指對基因組序列未知或無近緣物種基因組信息的某個物種，構(gòu)建不同插入片段的基因組文庫，基于 PacBio三代單分子測序技術(shù)結(jié)合二代高通量測序技術(shù)，對這些文庫進(jìn)行序列測定，利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行拼接，獲得完整的染色體及質(zhì)粒序列，解析編碼信息和表觀遺傳修飾信息。
應(yīng)用領(lǐng)域
l 獲得完整的染色體序列圖譜
l 獲得完整的質(zhì)粒或 BAC 克隆子序列圖譜
l 解析甲基化修飾相關(guān)信息（6mA和4mC）
派森諾優(yōu)勢
(1) 項(xiàng)目周期短：完成圖項(xiàng)目周期 15 工作日，平均項(xiàng)目周期 30 工作日；
(2) 方案設(shè)計(jì)合理：完成圖的方案以三代平臺為主、二代平臺為輔，得到完整的染色體和質(zhì)粒序列圖譜；
(3) 免費(fèi)贈送待測菌株的菌種鑒定，以防菌株錯測；
(4) 拼接結(jié)果準(zhǔn)確：三輪校正（拼接前利用三代測序數(shù)據(jù)間的 Overlap 對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行校正；拼接后，利用三代測序數(shù)據(jù)對拼接結(jié)果進(jìn)行第二輪校正；最后，利用高質(zhì)量的二代測序數(shù)據(jù)對拼接結(jié)果進(jìn)行多次校正）使得到的基因組拼接結(jié)果更加準(zhǔn)確；
(5) 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富：細(xì)菌完成圖已完成樣品數(shù)量近 300 例；
(6) 細(xì)節(jié)服務(wù)到位：無論是圈圖起始位點(diǎn)的調(diào)整，還是起始密碼子的翻譯（起始密碼子的氨基酸均為甲硫氨酸），力求做到滿意。
