宏基因組測(cè)序
宏基因組測(cè)序研究
宏基因組學(xué)(Metagenomics)研究通過全基因組鳥槍法(Whole Genome Shotgun，WGS)測(cè)序策略，將提取獲得的微生物組總DNA隨機(jī)打斷為短片段，并構(gòu)建合適長度的插入片段文庫，對(duì)這些文庫進(jìn)行雙端(Paired-end，PE)高通量測(cè)序，從而能精細(xì)地展示整個(gè)菌群的功能代謝譜和物種精細(xì)組成譜，進(jìn)而在組成和功能水平分別挖掘關(guān)鍵生物
標(biāo)記物，從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮作用的根本機(jī)制。
宏基因組測(cè)序項(xiàng)目流程
微生物組總DNA提取→DNA片段化→連接接頭序列→純化、富集DNA片段→測(cè)序文庫定量→上機(jī)進(jìn)行高通量測(cè)序→生信分析
宏基因組測(cè)序產(chǎn)品特點(diǎn)
1、直接對(duì)群落樣本中的基因片段進(jìn)行測(cè)序，真實(shí)再現(xiàn)群落復(fù)雜而精密的生態(tài)功能；
2、樣本類型涵蓋各類生境，微量提取成功率高；
3、使用Illumina NovaSeq超高通量測(cè)序平臺(tái)，速度更快周期更短；
4、功能+物種，雙管齊下；拼接+不拼接，各取所長，實(shí)現(xiàn)對(duì)物種和功能的“高分辨率”定量；
5、根據(jù)樣本、數(shù)據(jù)特征，自動(dòng)選擇分析流程，多種功能注釋數(shù)據(jù)庫可選，優(yōu)化宏基因組功能代謝譜注釋；
6、通過多種多變量統(tǒng)計(jì)分析和機(jī)器學(xué)習(xí)方法，系統(tǒng)、深入地挖掘宏基因組大數(shù)據(jù)中差異相關(guān)的關(guān)鍵物種和關(guān)鍵功能，識(shí)別關(guān)鍵生物標(biāo)記物。
