基因組從頭測序（de novo sequencing），主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構建不同類型的基因組DNA文庫，并進行序列測定。然后使用生物信息學方法對序列進行拼接、組裝和注釋，從而繪制該物種完整的基因組序列信息。簡單基因組：重復序列低于50%，且二倍體雜合度低于0.5%的物種。
復雜基因組：重復序列高于50%，或二倍體雜合度高于0.5%，或其他多倍體物種。
產品參數
測序方案 | 測序策略 | 交付指標 | 項目周期 | |
簡單基因組 | 純三代 | 文庫：20Kb 三代（80X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | Contig N50≥ 1Mb | （二代）40個自然日（標準分析）； （二代+三代+Hic）75個自然日（測序+組裝+注釋） |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 500Kb | ||
復雜基因組 | 純三代 | 文庫：20Kb 三代（100X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | 視物種而定 | |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 200Kb | ||
哺乳動物和鳥類 | 純三代 | 文庫：20Kb 三代（80X） | Contig N50≥ 3Mb | |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 1Mb |
