擴(kuò)增子/功能基因測序
擴(kuò)增子/功能基因測序借助合適的類群特異性引物，可以檢測菌群中特定種類/功能微生物的特征序列，反映菌群中該特定類群微生物的組成結(jié)構(gòu)，從而發(fā)現(xiàn)它們的分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而揭示該類群微生物中與差異相關(guān)聯(lián)的關(guān)鍵成員。
項(xiàng)目流程
微生物組總DNA提取→目標(biāo)片段PCR擴(kuò)增→擴(kuò)增產(chǎn)物檢測定量→測序文庫制備→上機(jī)進(jìn)行高通量測序 →生信分析
產(chǎn)品特點(diǎn)
對特定種類/功能的微生物群落進(jìn)行研究，比如產(chǎn)甲烷微生物、硝化/反硝化微生物等特定的微生物類群等，好比拿了一把“放大鏡”，而消除了其它不相干微生物類群的干擾。
實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)豐富：
樣本類型全。涵蓋動(dòng)植物、土壤、水體等各類生境；
基因種類多。涵蓋碳氮磷硫代謝、線粒體、葉綠體、重金屬抗性等；
派森諾分析深入：
FrameBot校正。糾正移碼錯(cuò)誤，去除非目的序列；BROCC注釋算法。替代BLAST，確保“真陽性”；NCBI-nt/nr數(shù)據(jù)庫、功能基因限定參考子集。
