全長轉(zhuǎn)錄組測序
基于PacBio三代測序平臺的全長轉(zhuǎn)錄組測序,可直接獲取mRNA全長序列,更為準(zhǔn)確地解讀mRNA結(jié)構(gòu)信息,重點關(guān)注基因的可變剪切、融合基因等。
測序應(yīng)用領(lǐng)域
◇ 獲得基因組未知物種的基因集,用于基因功能研究
◇ 基因結(jié)構(gòu)差異分析
◇ 發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本
◇ 分子機制研究
◇ 基因表達(dá)調(diào)控研究
派森諾測序的優(yōu)勢
◇ 完善的樣品提取檢測方案,保障 mRNA 的完整性;
◇ 派森諾擁有 PacBio Sequel 及 PacBio RSII 單分子測序平臺,提供測序服務(wù);
◇ 深度測序推薦,挖掘低豐度基因信息;
◇ 分析團隊,項目經(jīng)驗豐富,提供個性化分析內(nèi)容。
全長轉(zhuǎn)錄組實驗流程
1、樣品制備:總RNA提取
2、cDNA合成:Clontech SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit
3、文庫構(gòu)建: SMRTbellTM Template Prep Kit 1.0
4、上機測序:Sequel Sequencing Kit 2.0