微衛星(Microsatellite,MS)是指基因組中的短串聯重復序列。與正常組織相比，腫瘤組織的微衛星由于重復單位的插入或缺失而導致微衛星長度的改變，就叫做微衛星不穩定性(Microsatellite Instability，MSI)。大量研究表明，MSI是由于錯配修復(MMR)基因發生缺陷引起的，與腫瘤的發生密切相關。約15-20%的結直腸癌（CRC）主要是由MSI引起。 Lynch綜合征，又稱遺傳性非息肉病性結直腸癌(HNPCC)，是由MMR基因胚系突變所致的顯性遺傳病。研究表明，90%以上的Lynch綜合征具有MSI特征，而在散發性結直腸癌中MSI發生率約15%。NCI建議通過檢測基因組上的5個單核苷酸重復的微衛星位點（NR-21，NR-24，BAT-25，BAT-26，MONO-27），來判斷微衛星不穩定性程度。與正常組織相比，5個微衛星位點中2個或2個以上不穩定為高度微衛星不穩定（MSI-H）,1個位點不穩定為低度微衛星不穩定（MSI-L），5個位點均穩定則為微衛星穩定（MSS）。研究表明，Ⅱ期MSI-H結直腸癌患者可能預后良好且無法從5-FU的輔助化療中受益。臨床上已將MSI作為結直腸癌預后和制定輔助治療方案的重要分子標志物，并應用于協助Lynch綜合征篩查。
