CircRNA測序
CircRNA測序介紹
CircRNA（Circular RNA），是一類不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly（A）尾巴、并以共價鍵形成穩(wěn)定閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼 RNA 分子。 CircRNA 廣泛存在于生物細(xì)胞中，對 miRNA 起重要的調(diào)控作用，進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá)。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展， CircRNA 在多種真核生物體內(nèi)被大量鑒定出來，利用高通量測序技術(shù)，對生物樣本中的CircRNA 進(jìn)行鑒定、表達(dá)豐度檢測及結(jié)構(gòu)分析，是 RNA 領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)，推動更深入的基因表達(dá)研究。
CircRNA測序方案設(shè)計
CircRNA 實驗設(shè)計思路為差異比較，常見的類型為實驗組與對照組（case VS control），進(jìn)行兩兩比較；若考慮時空因素，如按照不同生長發(fā)育階段或者疾病發(fā)生發(fā)展整個過程進(jìn)行比較，即進(jìn)行多重比較分析，然后對差異的CircRNA 來源基因進(jìn)行預(yù)測和富集分析。一組樣品建議至少 6 個生物學(xué)重復(fù)。
