長(zhǎng)鏈非編碼 RNA(Long non-coding RNA, LncRNA)是長(zhǎng)度大于 200 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA(不含 rRNA)。研究表明 , LncRNA 在劑量補(bǔ)償效應(yīng)、表觀遺傳調(diào)控、細(xì)胞周期調(diào)控和細(xì)胞分化調(diào)控等眾多生命活動(dòng)中發(fā)揮重要作用,成為遺傳學(xué)研究熱點(diǎn)。通過 LncRNA 測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的 LncRNA 表達(dá)變化,促進(jìn)其深入研究。
LncRNA 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路為差異比較,常見的類型為實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組(case VS control),進(jìn)行兩兩比較;若考慮時(shí)空因素,如按照不同生長(zhǎng)發(fā)育階段或者疾病發(fā)生發(fā)展整個(gè)過程進(jìn)行比較,即進(jìn)行多重比較分析,然后對(duì)差異的LncRNA 進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)和富集分析。一組樣品建議至少 6 個(gè)生物學(xué)重復(fù)。