真菌全基因組從頭測序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指對基因組序列未知或無近緣物種基因組信息的某個物種,構(gòu)建不同插入片段的基因組DNA文庫并對文庫進行序列測定,然后利用生物信息學(xué)方法進行拼接、組裝和注釋,從而獲得該真菌的全基因組序列圖譜。
產(chǎn)品參數(shù)
1、簡單真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且雜合度 ≤ 0.5%且基因組 ≤ 40 Mb;
2、復(fù)雜真菌:G+C% > 65% 或 G+C% <35%或雜合度 > 0.5%或基因組 > 40 Mb;
Contig N50:將組裝得到的 Contig 按序列長度從長到短排序并依次累加,當累加長度正好到序列總長度 50% 時,最后一條序列的長度。
樣品要求
一、原樣類
二、核酸類