動植物基因組de novo測序
基因組從頭測序（de novo sequencing），主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構(gòu)建不同類型的基因組DNA文庫，并進行序列測定。然后使用生物信息學(xué)方法對序列進行拼接、組裝和注釋，從而繪制該物種完整的基因組序列信息。簡單基因組：重復(fù)序列低于50%，且二倍體雜合度低于0.5%的物種。
復(fù)雜基因組：重復(fù)序列高于50%，或二倍體雜合度高于0.5%，或其他多倍體物種。
產(chǎn)品參數(shù)
| 測序方案 | 測序策略 | 交付指標(biāo) | 項目周期 |
簡單基因組 | 純?nèi)?/span> | 文庫：20Kb 三代（80X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | Contig N50≥ 1Mb | （二代）40個自然日（標(biāo)準(zhǔn)分析）；
（二代+三代+Hic）75個自然日（測序+組裝+注釋） |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 500Kb |
復(fù)雜基因組 | 純?nèi)?/span> | 文庫：20Kb 三代（100X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | 視物種而定 |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 200Kb |
哺乳動物和鳥類 | 純?nèi)?/span> | 文庫：20Kb 三代（80X） | Contig N50≥ 3Mb |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 1Mb |
