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茶樹轉錄組測序揭示甲基-茉莉酮酸酯作用機制

2015-10-30

        甲基-茉莉酮酸酯為廣泛存在于植物中的誘導因子,可促進茶葉中香味的揮發。已有對茶葉中各種揮發物成分的報道,但關于這些揮發物的生物合成途徑的研究較少。


        中國農業科學院茶葉研究所林智研究員和他的團隊,通過轉錄組測序的方法,就不同甲基-茉莉酮酸酯處理時間的茶樹葉片的基因表達差異進行研究,于2015年9月30日發表題為Transcriptional responses and flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves的文章,文章發表在BMC Plant Biology(影響因子3.813)雜志上。

       

        茶樹葉片的轉錄組測序及信息分析工作,由上海派森諾生物科技有限公司完成。


        研究流程

        供試樣本:茶樹葉片

        處理條件:甲基-茉莉酮酸酯處理,分別處理0h,12h,24h,48h

        樣本數量:4

        分組信息:0h處理為對照,分別與不同時間的樣本進行比較

        測序平臺:Illumina MiSeq測序平臺

        分析內容:KEGG注釋、GO注釋、聚類分析、qPCR驗證等


        實驗結果

        12h,24h和48h處理組分別檢測到19245, 18614, 11890差異表達基因;α-亞麻酸降解途徑應答茉莉酮酸酯途徑,MEP/DOXP途徑的基因表達發生顯著變化;此外,類萜生物合成途徑的相關基因與對照組相比也發生顯著變化。


        分析結果展示

  1. 甲基-茉莉酮酸酯處理后,Unigenes的差異表達分析(圖1)

    實驗結果柱狀圖
    圖1 基因表達聚類分析

  2. Unigenes的基因功能注釋(圖2)


    實驗結果柱狀圖集錦


     圖2 基因功能注釋(上)GO注釋;(下)KEGG注釋

     

  3. qPCR檢測靶標基因表達量,驗證轉錄組測序的準確性(圖3)

圖3 qPCR驗證


參考文獻:

Jiang Shi et al. Transcriptional responsesand flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves. BMC Plant Biology (2015) 15:233


本文由市場部王智健博士整理


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