三代單分子測(cè)序技術(shù)檢測(cè)到的甲基化信息能有多豐富?
2017-11-17
三代單分子測(cè)序一個(gè)十分重要的優(yōu)勢(shì)是能夠同時(shí)獲得基因組中的甲基化修飾信息。當(dāng)基因組中某位點(diǎn)存在堿基修飾時(shí),測(cè)序速度會(huì)變慢,Pacbio公司得出檢測(cè)算法,可以識(shí)別m6A、m5C和m4C的甲基化修飾。近年來(lái),甲基化研究熱度居高不下。在細(xì)菌基因組中,N6-甲基腺嘌呤(m6A)和N4-甲基胞嘧啶(m4C)很常見(jiàn),它們作為限制修飾(RM)系統(tǒng)的一部分行使重要功能。三代單分子實(shí)時(shí)(SMRT)測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn),為甲基化位點(diǎn)的定位提供了簡(jiǎn)單高效的方法,事實(shí)上,三代測(cè)序所能提供的甲基化信息遠(yuǎn)比我們想象中豐富。