本研究使用的兩種狍：歐洲狍和西伯利亞狍，其中圖中紅色三角形表示的為本研究中的四個(gè)狍采樣點(diǎn)。其他的狍由四種不同顏色的點(diǎn)表示，數(shù)據(jù)來(lái)自已發(fā)表的文章。本文有四個(gè)數(shù)據(jù)集分別用于不同分析：
數(shù)據(jù)集1包括了已發(fā)表的22個(gè)線(xiàn)粒體基因組，其中11只為西伯利亞狍、9只歐洲狍、1只中國(guó)牙獐、1只遠(yuǎn)東駝鹿，另加本研究中新獲得的4個(gè)古線(xiàn)粒體基因組。該數(shù)據(jù)集保留了最完整的序列，用于狍種群的系統(tǒng)發(fā)育和分子測(cè)年分析。
數(shù)據(jù)集2包括了來(lái)自具有詳細(xì)地理信息的146個(gè)樣本的cytb基因和D環(huán)序列，其中141只為現(xiàn)代西伯利亞狍（涵蓋韓國(guó)、蒙古、哈薩克斯坦、西伯利亞和波蘭），本研究中新獲得的四只中國(guó)狍化石樣本，以及一只歐洲狍作為外類(lèi)群。該數(shù)據(jù)集在西伯利亞狍的大部分地理范圍內(nèi)菌采集了大量個(gè)體，用于研究西伯利亞狍的系統(tǒng)地理結(jié)果。
數(shù)據(jù)集3包括了11只現(xiàn)代西伯利亞狍完整線(xiàn)粒體基因組和本研究的四個(gè)古化石樣本，用于重建西伯利亞狍的母系種群歷史。
數(shù)據(jù)集4包括了現(xiàn)代9個(gè)現(xiàn)代歐洲狍的完整線(xiàn)粒體基因組，用于重建歐洲狍的母系種群歷史。
圖1 兩種狍（C.capreolus和C.pygargus）的地理分布范圍
先前的分子鑒定表明，現(xiàn)存的中國(guó)東北狍為西伯利亞狍，但是否為亞種任存在爭(zhēng)議。本研究基于數(shù)據(jù)集1構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，表明狍主要分為兩大類(lèi)即歐洲狍和西伯利亞狍，而西伯利亞狍又進(jìn)一步分為三個(gè)不同的亞類(lèi)，亞類(lèi)P3占據(jù)稍早的發(fā)散位置，而亞類(lèi)P1和P2彼此是姊妹。有趣的是，本研究的四個(gè)古代樣本屬于西伯利亞狍的兩個(gè)不同亞類(lèi)，CADG573和626位于P2亞類(lèi)，而580和842位于P3亞類(lèi)。分歧時(shí)間樹(shù)表明：西伯利亞狍和歐洲狍在2.25 Ma分開(kāi)，這與之前的分子結(jié)果一致。而西伯利亞狍P1、P2和P3亞類(lèi)分別在0.10 Ma、0.17 Ma和0.30 Ma分開(kāi)。
