2019-06-04
斑馬魚由于具有繁殖能力強、體外受精和發(fā)育、胚胎透明、性成熟周期短、個體小易養(yǎng)殖等諸多特點，使其成為功能基因組時代生命科學研究中重要的模式脊椎動物之一。在短短一周內，由派森諾助力的兩篇斑馬魚文章相繼被發(fā)表，影響因子分別為5.587與3.884。這些研究將RNA-Seq與small RNA-Seq應用到分子調控機制的研究當中，解釋了斑馬魚性腺發(fā)育調控機制與毒素反應機理。
Article 1
由派森諾與上海海洋大學合作發(fā)表于《Stem Cells》，影響因子5.587。
研究背景
生育和內分泌功能依賴于下丘腦-垂體性腺(HPG)軸的緊密同步調節(jié)，性腺是性類固醇激素和生殖細胞的主要來源。為了在整個生命周期中保持荷爾蒙平衡和生育能力，誘導性腺干細胞更新是一個有吸引力的策略。FSH /cAMP/ MAPK /Sox9信號軸及其調控的特異性miRNA被認為是調節(jié)脊椎動物性腺的發(fā)育和性別分化，然而調控網絡在很大程度上是未知的。
研究思路
研究結論
小分子RNA和小分子cocktail能夠操縱干細胞和分化細胞的細胞命運和可塑性。然而,表型性腺的轉化需要多種體細胞和生殖系統(tǒng)的復雜協(xié)調。本研究進行全基因組轉錄組挖掘，以確定miRNA-mRNA對在斑馬魚睪丸發(fā)育和卵泡發(fā)育調控中的作用。然后進行了性腺顯微注射，發(fā)現(xiàn)了兩個特異性miRNA-GPCR-Sox9a/- Sox9b網絡在調節(jié)性腺分化和更新。預測未來的研究將數(shù)以百計本研究中發(fā)現(xiàn)的其他miRNA-GPCRs靶對，這不僅有助于我們了解miRNA在調控細胞命運可塑性方面的分子機制，還為進一步研究miRNA在調控細胞命運可塑性方面的作用以及尋找新的性腺再生治療靶點的方法奠定了基礎。
Article 2
由派森諾與武漢大學合作發(fā)表于《Aquatic Toxicology》，影響因子3.884。
研究背景
微囊藻毒素(MC-LR)是一種劇毒的肝毒素，對水生生物乃至人體健康都有極大的危害。斑馬魚肝細胞系(ZFL)是研究毒物毒性和代謝的重要模型。然而，MC-LR的毒性及其對ZFL細胞基因轉錄的影響仍有待研究。
研究思路
研究結論
本文研究了斑馬魚肝臟細胞對MC-LR的轉錄反應。大量的MC-LR調控基因和選擇性剪接事件被發(fā)現(xiàn)。對基因轉錄數(shù)據(jù)進行共表達模組分析MC-LR轉錄反應的復雜性。MC-LR對生物過程和細胞信號通路的影響具有高度的時間依賴性。利用基因轉錄數(shù)據(jù)構建了一個基因調控網絡，并確定了潛在的hub基因。研究結果闡明了MC-LR細胞毒性的分子機制，以及MC-LR毒性的轉錄組結構下的基因調控回路。
參考文獻
1、Guo H, Du X, Zhang Y, et al. Specific miRNA‐GPCR networks regulate Sox9a/Sox9b activities to promote gonadal rejuvenation in zebrafish[J]. STEM CELLS, 2019.
2、Lu X, Tian J, Wen H, et al. Microcystin-LR-regulated transcriptome dynamics in ZFL cells[J]. Aquatic Toxicology, 2019, 212: 222-232.
