簡(jiǎn)介:
中華絨螯蟹（Eriocheir sinensis）是一種經(jīng)濟(jì)蟹類，又稱河蟹、毛蟹、清水蟹、大閘蟹，為中國(guó)久負(fù)盛名的美食。中國(guó)境內(nèi)廣泛分布于南北沿海各地湖泊，蟹中含有較多的維生素A，對(duì)皮膚的角化有幫助；對(duì)兒童的佝僂病，老年人的骨質(zhì)疏松也能起到補(bǔ)充鈣質(zhì)的作用。中華絨螯蟹中性別偏好基因在雌雄個(gè)體中基因表達(dá)存在差異，為了探索蟹的性別偏向型基因表達(dá)，對(duì)雌雄個(gè)體的中華絨螯蟹進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，探究性別偏好基因的表達(dá)差異，探討兩性異形的分子機(jī)制。
以中華絨螯蟹為例的海洋生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的情況是怎么樣的呢？中科院海洋研究所的劉媛教授和她的團(tuán)隊(duì)對(duì)雌雄中華絨螯蟹的樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，結(jié)果共驗(yàn)證148個(gè)性別相關(guān)基因，檢測(cè)到29個(gè)性別決定通路；不同性別的差異表達(dá)基因與新陳代謝和免疫相關(guān)；并證實(shí)某些性別相關(guān)基因在雌雄個(gè)體中表達(dá)存在顯著差異，大多數(shù)差異基因參與新陳代謝和免疫等過(guò)程，而不是明顯與性功能相關(guān)。
免疫通路的差異基因中，雌性個(gè)體中18個(gè)上調(diào)基因由體液免疫因素引起，雄性個(gè)體中8個(gè)上調(diào)的差異基因是在模式識(shí)別受體上，這表明免疫防御的性別差異可能存在于中華絨蝥蟹中，本研究將為進(jìn)一步研究中華絨螯蟹的雌雄異型提供分子機(jī)制。該研究成果Comparative Transcriptome Analysis Reveals Sex-Biased Gene Expression in Juvenile Chinese Mitten Crab Eriocheir sinensis于近日發(fā)表在PLoS ONE（影響因子3.234）雜志上。
中華絨螯蟹的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及信息分析工作，由上海派森諾生物科技股份有限公司完成，這也是我公司完成的第二篇中華絨螯蟹文章。
方法：
雌雄中華絨螯蟹個(gè)體
樣本量：
2個(gè)樣本
測(cè)序平臺(tái):
Proton平臺(tái)
分析內(nèi)容:
1、 SNP分析
2、 GO注釋
3、 特定代謝通路分析
4、 qPCR驗(yàn)證
結(jié)果:
共驗(yàn)證148個(gè)性別相關(guān)基因，檢測(cè)到29個(gè)性別決定通路；不同性別的差異表達(dá)基因與新陳代謝和免疫相關(guān)；并證實(shí)某些性別相關(guān)基因在雌雄個(gè)體中表達(dá)存在顯著差異。
部分結(jié)果展示:
圖1 SNP位點(diǎn)分析
圖2 溶酶體代謝通路基因表達(dá)差異分析
析
圖3差異表達(dá)基因GO注釋
參考文獻(xiàn)
Yuan Liu, Min Hui el.Comparative Transcriptome Analysis Reveals Sex-Biased Gene Expression in Juvenile Chinese Mitten Crab Eriocheir sinensis.PLoS One.(2015)1-21.
