微生物繪圖高頻圖表—差異檢驗(yàn)箱線圖
2023-03-15
差異統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)是科學(xué)研究的重要組成部分，其分析結(jié)果可用于檢驗(yàn)我們實(shí)驗(yàn)結(jié)果的真實(shí)性、準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。派森諾基因云推出的小工具——差異檢驗(yàn)箱線圖，理論上可用于任何數(shù)據(jù)的差異檢驗(yàn)分析。
例如，對(duì)于微生物組研究，我們可以用差異檢驗(yàn)箱線圖對(duì)不同物種的豐度或功能基因的含量進(jìn)行組間差異統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)，還可以比較Alpha多樣性指數(shù)的差異大小等等，適用的繪圖場(chǎng)景很多，一起來(lái)看看吧。
每組至少3個(gè)樣本，每列數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)一個(gè)箱線圖子圖。
P值：展示Kruskal-Wallis非參數(shù)檢驗(yàn)獲得的組間總體差異的P值。
*號(hào)：展示各組之間Dunn's test事后兩兩比較獲得的差異顯著性水平（*，P<0.05；**，P<0.01；***，P<0.001）。
帶端點(diǎn)的橫線：代表是橫線兩端的兩組之間的比較。
如果您是云分析項(xiàng)目用戶，首先找到云分析模塊，進(jìn)入微生物群落多樣性組成譜分析系統(tǒng)頁(yè)面，通過(guò)點(diǎn)擊【立即體驗(yàn)】按鈕進(jìn)入分析界面，找到【 序列處理分析 → 物種分類學(xué)注釋 】這一章節(jié)，分別下載數(shù)據(jù)文件和分組文件，然后在云圖匯中上傳使用。
分組文件下載之后，需要刪除多余的樣本列數(shù)據(jù)，然后導(dǎo)出文件即可。:04
當(dāng)然，除了從分析系統(tǒng)導(dǎo)出數(shù)據(jù)，差異檢驗(yàn)箱線圖同樣支持其他途徑數(shù)據(jù)，只要符合規(guī)定的繪圖數(shù)據(jù)格式即可。
第一列為樣本名稱，其他列為相關(guān)變量名稱。
分組文件：
第一列為樣本名稱，第二列為分組名稱。調(diào)整分組文件中的分組順序，就等于調(diào)整圖形中分組的實(shí)際顯示順序。
面板寬度
合理地調(diào)整圖表面板寬度，可以展示更好的圖表效果。
