2022-12-08
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單細胞和空轉技術宣傳如火如荼，那么它們到底是如何解決科學問題的呢，小派再來做個簡述~~
單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術目前已經成為解開單個細胞內RNA轉錄本的異質性和復雜性，以及揭示高度組織的組織/器官/有機體中不同細胞類型的組成和功能的最先進方法。但是scRNA-seq可以識別組織內的細胞亞群，卻不能捕捉它們的空間分布，也不能揭示作用于細胞間通訊的局部網絡。因此為了解決這一問題，空間轉錄組應運而生，空轉技術不僅能夠帶來轉錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉錄的位置。因此scRNA-seq和空間轉錄組學搭配起來，可以在其天然組織環境中定位具有轉錄特征的單個細胞。整合scRNA-seq和空間轉錄組學數據可以增加人們對特定細胞亞群的作用及其在發育、穩態和疾病中相互作用的理解。
單細胞測序技術在不同物種的應用（文獻1）
單細胞和空轉聯合分析應用解析（文獻2）
我們知道細胞本身包含DNA，RNA，蛋白質，代謝產物等多種分子，各種分子共同作用組成系統整體。因此單一的轉錄組并不能全面體現細胞的變化。為了更加全面系統的解讀生命機制，單細胞多組學越來越受到廣大科研工作者的青睞。了解了單細胞和空轉搭配的好處，那么具體二者或者和其他組學要怎么來進行設計搭配呢，不急，小派整理了以下思路可供參考：
單細胞多組學整合研究
文獻思路可以參考 (點擊標題查看)：
1、單細胞與空間轉錄組聯合解析人體腸道發育的時空變化
2、Nature│空間多組學測序繪制人類心肌梗死圖譜
3、單細胞轉錄組+bulk轉錄組+代謝組聯合研究解析肌肉內脂肪浸潤對骨骼肌發育的影響
參考文獻：
[1]Jovic D, et al. Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview. Clin Transl Med. 2022 Mar;12(3):e694.
[2]Longo SK, Guo MG, Ji AL, Khavari PA. Integrating single-cell and spatialtranscriptomics to elucidate intercellular tissue dynamics [published onlineahead of print, 2021 Jun 18]. Nat Rev Genet. 2021;10.1038/s41576-021-00370-8.
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