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一個基因如何畫出好看的熱圖?

2021-03-23


在科研數據分析中,我們往往是抽絲剝繭,希望找到幾個,最好就是一個關鍵基因,比如我們想找易感基因、驅動基因、Marker基因等。當然功夫不負有心人,最終我們都可能如愿以償!但后續如何把結果呈現出來,卻不知所措了:一個基因的數據該如何可視化?可以畫熱圖嗎?

一般的情況,我們畫出來的圖是這樣的:

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圖1 普通熱圖


如何完善上面的圖呢?首先我想到的兩個思路是:1. 把熱圖掰彎變成環形熱圖;2. 調整熱圖的圖例及比例構成。那么如何實現呢?接下來我們可以通過“派森諾基因云(https://www.genescloud.cn)”的“交互原值熱圖”進行實現。


一、準備數據

準備圖2, 圖3 所示數據,“交互原值熱圖”工具支持兩種類型的數據。

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圖2  縱向數據

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圖3  橫向數據


二、提交繪圖

上傳數據后,一鍵提交繪圖。

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圖4 提交數據繪圖


三、參數調整

在圖表調整里面,選擇【圖表設置→圖表類型→圓形圖】,除了對圖表類型外,還可以對圖表的顏色及圖例等樣式進行設置。

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圖5 選擇圓形圖

不同的數據結構,得到的圖也不一樣,如下所示:

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圖6 縱向數據結果圖

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圖7 橫向數據結果圖


如果對上述圖還有更加個性化的要求,大家可以下載pdf或者svg格式的圖片,導入AI軟件進行處理,比如調整字體、圖例位置等。下面給大家分享一個圖形換色的功能。點擊AI軟件【編輯→編輯顏色→重新著色圖稿】,可以根據需要選擇互補色、近似色等智能推薦方案,也可以自定義更改目前的顏色。

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圖8  編輯顏色

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圖9 編輯顏色面板

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圖10 調色后示例


趕緊來試一試吧,百度搜索“派森諾基因云”或者直接訪問https://www.genescloud.cn/home,進入“云圖匯”搜索“熱圖”嘗試體驗,并提寶貴建議至平臺消息中心-》反饋列表,或者發送到郵箱:[email protected]。"派森諾基因云" 一直持續上心上新,接下來會有更多好圖好工具陸續和大家見面,歡迎大家關注并進行體驗。


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