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教你學一招繪圖融合技和散點圖say bye bye

2021-03-11

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在日常工作中,我們經常會進行探索性數據分析(EDA),來查找不同數據間的模式、關系或異常情況,以便為我們后續工作提供參考。散點圖就是我們常用的工具之一,它可以讓我們看到兩個變量之間的相關性。

然而實際作圖時,面對琳瑯滿目的工具,我們經常無所適從,當散點圖密密麻麻,雜亂無章時,我們也很難發現數據間的相關性和趨勢。那該怎么破呢?今天就給大家從Excel,Python,云平臺三個方面講解下分組散點圖,密度圖的繪制方法,大家可以選擇性查看對應內容,希望這篇分享能夠給大家在數據可視化精進的道路上有所幫助!

一、Excel:三步實現分組散點圖

首先我們看看示例數據。如下圖所示,數據包含三列,第一列為分組:A,B,C三個組,第二列為變量:長度(Length)和深度(Depth)的值。主要目的是想了解下不同組的數據長度和深度分布相關情況。

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為了便于大家練習,示例數據已上傳基因云平臺,大家可以從 “基因云(https://www.genescloud.cn/home)”,【云圖匯→組合密度圖】 中下圖所示位置下載。

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數據準備好了,接下來我們開始EDA。按照常規的操作,【選中數據→插入散點圖】,結果發現無論選擇哪個類型的散點圖,出現的都只有Length和Depth兩個系列的值,并沒有按照我們想要的分組進行展示。如何解決呢?接下來我們就看看,如何實現繪制分組散點圖。

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1.1、插入空白散點圖

把鼠標放在空白單元格(重點!),依次點擊【插入→散點圖】,插入空白的散點圖。

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1.2、為空白圖添加數據

【選擇空白圖表右鍵→選擇數據】彈出【選擇數據源】窗口,【圖例項(系列)】下點擊“添加”圖標,彈出【編輯數據系列】窗口,輸入系列名稱,選擇好對應組別的 X Y軸系列值,這里分別是Length,Depth對應的值。

下圖演示的是添加A組的數據,類似操作依次選擇添加B,C組的數據。最終可以看到三個組的數據用不同顏色進行了顯示。

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從圖中可以看出,初始圖中存在很多的空白,很多點堆積在一起,也沒有圖例,離高質量圖表還有很大的差距呢。別急,接下來我們進一步調整下相關參數。


1.3、更改圖表樣式參數

① 【右鍵圖表區域→設置坐標軸格式】調整XY軸最小值,本例分別為40,15,使得點充分展開。

② 【點擊圖表右上角的“+”圖標→勾選圖例】 可以看到包含A,B,C三個組的圖例出現了。

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為了進一步美化,達到期刊發表級別要求,我們還可以嘗試添加XY軸刻度,去掉多余的網格線,給圖例添加邊框,設置點的填充透明度等使得圖表更加簡潔,有層次感和呼吸感。到此,一個分組散點圖就完成了!

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操作到這,小伙伴們可能會問了,要是我們的數據有很多組,上述操作就太費勁了,還有上面的散點圖很多數據點是重疊的,不能很好的查看數據實際分布密度情況。有沒有解決辦法呢?接下來向大家介紹python實現分組散點圖和密度圖的繪制方法。



二、Python:一行命令實現分組散點密度圖

數據還是上面Excel所用的數據,按照如下命令,依次導入需要的模塊和數據,然后利用一條命令就可以繪制出散點密度圖!只要一條命令!!!簡單的是不是難以置信!此處應該有掌聲!

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接下來,小伙伴們又要舉手了,上面的圖要是想調整下顏色,透明度,點的大小形狀,標題標簽樣式等如何實現呢?還有上面的圖好像有點重復,可不可以合并成一個散點圖和密度分布圖呢?數據點密集還是看不清數據的密度分布情況。怎么辦,繼續寫代碼,加入更多參數嗎?要是我不會寫代碼如何實現呢?為此,基因云平臺小伙伴們特此精心研發了一款“組合密度圖”,輕松解決上述所有問題和煩惱,趕緊的上車去學習使用吧......


三、基因云:一鍵出圖,百款樣式隨意調

進入基因云平臺【云圖匯→組合密度圖】,在【圖表數據→文件上傳】頁面選擇數據文件后,點擊“提交繪圖”,即可獲得漂亮的組合密度圖。

進入【圖表調整】頁面,可以實現核密度圖、回歸密度圖、直方密度圖等多種類型圖表的隨意切換,分組的任意刪減和排序,以及上百種樣式的自由調整。

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