2020-12-23
派森諾基因云9月份上線了真核有參轉錄組云分析(【派森諾基因云】有參轉錄組交互分析系統開學開啟,一鍵解鎖精準分析!點擊查看),12月份又上線了一系列小工具(12月的第一批高效精美作圖小工具熱血上線,你get了嗎?點擊查看) ,為了讓廣大用戶有更好的分析體驗,云分析和小工具也在不斷升級,今天就來一起看看基因云的新面貌!
一、根據內部使用和用戶反饋,轉錄組云分析進行了幾大板塊的更新:
1、項目概況部分-在界面添加參考基因組的注釋表格的下載:
2、表達差異分析-差異基因韋恩圖-分析設置增加了可以自由選擇比較組的功能,大家可以根據自己的需求自行繪制需要的venn圖:
3、表達差異分析-聚類分析,熱圖開發了優化版,可以直接在圖表調整部分,調整配色,圖片高度,聚類方式,圖例和標簽大小等,參數確定后,點擊下方“更新繪圖”按鈕,一鍵更新,即時獲取新熱圖:
二、為了更好的提供個性化的補充分析,云圖匯增加了轉錄組相關適用工具:
1、交互相關系數圖-想要單獨對已有的表達量的數據表格自行進行相關性分析,可以選擇“交互相關系數圖”,根據示例提交數據后,點擊“提交繪圖”,即可在“圖表調整”區域進行顏色,聚類方式,方法,圖例等調整:
2、交互火山圖-想要對自己整理的數據,有倍數,有p值,單獨拿來進行繪制火山圖,可以選擇“交互火山圖”,按照示例上傳文檔后,點擊“提交繪圖”,即可在“圖表調整”區域進行顏色,點大小,倍數,p值范圍,圖例等的調整:
3、熱圖或者是交互熱圖-想要對篩選得到的目的基因進行熱圖的繪制,可以選擇“熱圖”或者“交互熱圖”,按照示例上傳文檔后,點擊“提交繪圖”,即可在“圖表調整”區域進行顏色,數據處理方法,圖例等的調整,點擊“更新繪圖“即可獲得新的結果:
4、GO富集分析或者KEGG富集分析-要對篩選得到的目的基因進行富集分析的繪制,基因功能富集可以選擇“GO富集分析”,代謝通路富集可以選擇“KEGG富集分析”,按照示例上傳文檔后(KEGG富集分析還需要選擇物種),點擊“提交繪圖”,之后點擊右上方“結果查看”按鈕進入分析進程頁面,顯示分析完成后,即可點擊進入結果查看,此時可以在“圖表調整”區域進行顏色,圖表展示形式,圖例等的調整:
常規分析,云分析可以一網打盡;目的基因的挖掘后的熱圖到富集分析,云圖匯可以一一實現??靵睃c擊注冊派森諾基因云(https://www.genescloud.cn/),自由玩轉轉錄組分析吧!