2020-11-30
關于DIA,你是否已經聽了太多次,但依舊似懂非懂,腦袋一團亂麻?
今天小派就給大家介紹一下蛋白質組質譜檢測技術— DIA(數據非依賴采集技術,data-independent acquisition)。
研究基因組和轉錄組學的老師也不要錯過哦,畢竟蛋白質才是生物功能的主要體現者與執行者,才能更直接闡明生命在生理或病理條件下的變化機制。
什么是DIA?技術原理?
DIA(Data independent acquisition)是一項全新的、全息式數據非依賴性采集定量技術,可以依次對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離子的碎片離子信息進行蛋白定性和定量。
DIA技術是先利用常規DDA質譜檢測技術分析建立圖譜庫,之后采用DIA方法進行質譜數據采集,從而實現對樣品中蛋白質的定性及定量,不同于傳統的DDA技術,DIA技術將整個質譜掃描質量范圍分為若干小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描,再進行二級MS/MS分析,該技術無需指定目標肽段,可以無遺漏地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息,數據利用度大大提高。
DIA技術流程?
DIA技術作為一項新技術,還有需要完善的地方。技術難點主要在于二級譜圖成分復雜,生信分析較為困難。因而,目前要想采用DIA技術,必須先利用常規DDA質譜檢測技術分析建立圖譜庫,之后采用DIA方法進行質譜數據采集,從而實現對樣品中蛋白質的定性及定量。
DIA技術流程
DDA與DIA的區別?
DDA二級質譜只能夠采集一級譜圖信號最強的 Top20 的信息,所以說會造成信息遺漏。DIA將質譜整個全掃描范圍分為若干個窗口,高速、循環地對每個窗口中的所有離子進行選擇、碎裂和檢測,因此可以無遺漏地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息,數據利用度大大提高,缺失值更少。因此,DIA技術更適合大量樣本、復雜體系的蛋白檢測。
DIA技術優勢?
相對于傳統的是DDA,DIA具有如下技術優勢:
● 全景式掃描,數據無遺漏,蛋白質覆蓋率、定量準確性高
● 樣本無需分餾分上機,極大縮短了每個樣品的檢測周期;不受樣本量限制,可用于大規模樣本數量檢測
● 相比于DDA模式,DIA缺失值更少,鑒定與定量結果的可重復性更高,數據可回溯
DIA應用領域?
DIA主要用于大規模尋找差異蛋白和大樣本量的定量研究,并且因為DIA在鑒定蛋白數目、重復性、定量準確性等方面都優于DDA,數據利用度大大提高,因此也非常適合應用于生物標記物的篩選。