2020-08-06
在“與DNA提取有關的那些事（一）（點擊查看）”文章中，我們簡單介紹了DNA提取原則和原理等。
但由于自然界物種豐富，老師們研究物種的組織部位、生理生化特性各異，進而增加了DNA提取的難度。糖類、酚類、蛋白、油脂、次生代謝物等都會影響DNA的得率和完整性。
今天我們就目前遇到的部分困難樣本展開簡短的總結和結果展示。
一、不同類型難提取樣本特點分析
二、幾種難提取樣本案例展示
1.薔薇科植物、真菌
主要問題：多糖、多酚、多次生代謝物。
改良方案：公司擁有發明專利的“多糖多酚植物基因組的提取方法”，能有效去除多糖多酚、得到高純度高質量的DNA。利用改良真菌CTAB法，對不同物種的真菌提取會更有針對性、效率更高。
提取結果：(使用多糖多酚提取法進行提取，并對8、14號樣本進行針對性優化）
圖1 秋海棠科不同物種提取結果
圖2 針對特殊物種進行再次優化
圖3 多次生代謝物真菌（攀枝花白塊菌）
2.太歲
主要問題：是由粘菌、細菌和真菌三類菌構成的一種稀有的聚合體，研究成果較少。樣本取樣部位不確定，雜質多，得率低。
改良方案：實驗室針對已知物種特性，以沉淀法為基礎，通過多次改良，總結出一種適用于太歲的特殊提取法，有效的提高了DNA的質量。
提取結果：
圖4 太歲優化前后對比
3.孢子、堅強芽孢桿菌等
主要問題：細胞壁由一層較厚(10-50nm)的含胞壁酸的肽聚糖構成，一般方法不易破壁，得率低，易降解。
改良方案：選擇合適的研磨條件，加大裂解力度，添加輔助破壁的酶類試劑。
提取結果：
圖5 兩種厚壁物種CTAB法提取結果
圖6 兩種厚壁物種改良CTAB法提取結果
4.小型昆蟲
主要問題：個體小，角質較豐富、組織萎縮較嚴重。
改良方案：實驗室有相對應的昆蟲組織提取法。
提取結果：
圖7 不同物種、不同保存方式提取結果
5.水母
主要問題：身體主要成分是水，有很厚的中膠層，部分物種還含有大量的蛋白質，核酸含量較低。
改良方案：實驗室對原有CTAB法進行了針對性的優化，增加了對樣品的前處理，效果明顯。
提取結果：
圖8 一種霞水母科普通提取（左）和優化后（右）結果
以上為大家列舉了派森諾實驗室對幾種困難樣本的改良結果。在多糖菌類、微量樣本、發酵樣本、非常見物種等方面，也創新出了很多高效的針對性方法，就不一一給大家列舉了。
希望我們方法的多樣性及靈活性能給您的科研項目帶來幫助~~
