2020-07-15
大家好,今天我是
來做自我介紹噠。
我是近些年來的“國自然”的熱門選手——m6A甲基化修飾。
如果你還不了解我,沒關系,請繼續往下看我的簡歷內容,相信你也會愛上我,pick我~~
圖1 m6A相關的近十年基金項目統計
姓名:m6A甲基化修飾
出生日期:20世紀70年代出生,被發現,近些年被重視。
本性:我是RNA分子上的一種修飾形式,腺嘌呤的6號碳原子連接的氨基基團中的一個氫被甲基基團取代就成了我,在人和小鼠中有近二分之一的mRNA中有我的存在。
●“pick me”的理由一 ●
mRNA分子內部除了有我m6A修飾,還有m1A、m5C等修飾類型,但是我的存在感最強(是最常見的RNA修飾類型之一),研究我的技術比較多比較成熟,所以我是我們兄弟姐妹中的老大,我受到的關注最多。
圖2 mRNA常見的7種修飾類型
(Li X , Xiong X , Yi C . Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications[J]. Nature Methods, 2016, 14(1):23.)
●“pick me”的理由二 ●
目前科研領域中,多組學聯合分析是一大熱點,我和我的好朋友轉錄組聯合,可以計算甲基化效率,明確修飾調控帶來的mRNA表達的影響;我和我的另一位好朋友翻譯組的聯合分析,可以挖掘m6A修飾對mRNA翻譯成蛋白質這一水平帶來的下游影響,有利于揭示m6A的下游調控機制機理。
圖3 m6A修飾多組學聯合分析
●“pick me”的理由三 ●
適用的研究范圍較為廣泛,現有的m6A修飾和眾多研究領域關系緊密,植物,動物,真菌均存在一定的生理調控過程與m6A修飾有關,比如腫瘤的增殖,斑馬魚和果蠅的胚胎發育,擬南芥的開花過程等等。
圖4 m6A修飾研究應用領域
以下是近些年關于m6A的相關綜述和擬南芥,斑馬魚和腫瘤細胞等樣本的相關研究,供大家進一步了解。
參考文獻:
1.Li, X. , Xiong, X. , & Yi, C. . (2016). Epitranscriptome sequencing technologies: decoding rna modifications. Nature Methods, 14(1), 23.
2.Luo, G. Z. , Macqueen, A. , Zheng, G. , Duan, H. , Dore, L. C. , & Lu, Z. , et al. (2013). Unique features of the m6a methylome in arabidopsis thaliana. Nature Communications, 5, 5630.
3.Jiang, Y. , Wan, Y. , Gong, M. , Zhou, S. , & Cheng, W. . (2020). Rna demethylase alkbh5 promotes ovarian carcinogenesis in a simulated tumour microenvironment through stimulating nfκ b pathway. Journal of Cellular and Molecular Medicine(1).
4.Ting, Sun, Ruiyan, Wu, Liang, & Ming. (2019). The role of m6a rna methylation in cancer. Biomedecine & Pharmacotherapie.
5.Zhao, B. S. , Wang, X. , Beadell, A. V. , Lu, Z. , Shi, H. , & Kuuspalu, A. , et al. (2017). M6a-dependent maternal mrna clearance facilitates zebrafish maternal-to-zygotic transition. Nature, 542(7642), 475.
6.Duan, H. C. , Wei, L. H. , Zhang, C. , Wang, Y. , Chen, L. , & Lu, Z. , et al. (2017). Alkbh10b is an rna n6-methyladenosine demethylase affecting arabidopsis floral transition. The Plant Cell, tpc.00912.2016.