2020-01-07
2020年已經到啦，新年快樂！新的一年，順利拿到轉錄組測序結果的小伙伴們，趁著年關，都開始忙活起數據的深度挖掘了，這一開始搞數據，各種各樣的問題就隨之而來，比如：
哎呀，我找到的這些基因，怎么把它們對應的表達量，差異結果和注釋放在一張表里呢？？
這個多組差異基因在一起的表格，沒有注釋呢，怎么加上去？？
下面，咱們就來看看用EXCEL的函數，簡單快捷的實現，將多個表格里面，相同的基因ID對應的信息整理在一起。
1、首先通過差異倍數或者GO和KEGG的富集分析結果，挑選出一些目的基因，示例如下：
2、添加表達量信息，打開expression表格，總表中是所有基因的reads count和FPKM，我們將FPKM添加到目的基因表格中:
3、在1中的表格的B列，輸入=VLOOKUP(可以將不同表格對應起來的值,需要對應的信息所在的表格，對應后需要輸出的信息在表格的哪一列，匹配時使用精確匹配)
對應在表格中即為=VLOOKUP(A2(即1中的基因ID，因為兩個表格可以對應的是基因ID)，[Expression.xlsx]Sheet1!$A:$F（需要對應的是Expression.xlsx表格的Sheet1的A-F列，也可以選擇全表）,4（即需要輸出的是第一個樣本的FPKM值，該結果在選中的表達量的表格的區域，在第4列的位置）,FALSE（即匹配時使用精確匹配）)
這樣就可以直接目的基因在獲得KB樣本的FPKM值，同理可以在下一列輸入：
=VLOOKUP(A2(即1中的基因ID，因為兩個表格可以對應的是基因ID)，[Expression.xlsx]Sheet1!$A:$F（需要對應的是Expression.xlsx表格的Sheet1的A-F列，也可以選擇全表）,6（即需要輸出的是第二個樣本的FPKM值，該結果在選中的表達量的表格的區域，在第6列的位置）,FALSE（即匹配時使用精確匹配）)，從而獲得F列Gab樣本的FPKM:
4、按照相同的方法，可以將基因的注釋也加入到第一部分的目的基因表格中，需要的信息在annotation表中的話，注釋表格如下：
輸入：
=VLOOKUP(A2(即1中的基因ID，因為兩個表格可以對應的是基因ID)，[Annotation.xlsx]Sheet1!$1:$1048576（需要對應的是Annotation.xlsx]表格的Sheet1的全表）,7（即需要輸出的基因的名字，該結果在選中的表格的區域的第7列的位置）,FALSE（即匹配時使用精確匹配）)
5、第一行的第一個基因需要的信息均調取過來后，可以點擊單元格的右下角，出現“+“后，雙擊，即可獲得所有行的信息：
按照以上的方法，基本可以實現同一個基因，在不同表格中的信息的調取，不管是表達量，注釋信息還是其他的對應信息都可以按照此方法操作，如此實用的技巧趕緊get起來！！
！！！但是需要注意的一點！！！
一定要保證，做對應關系的值，即上文所說的基因ID，也可以是其他的，像基因name等，該值在對應的需要搜索的表格中，即上述提到的表達量的表，注釋表，或者其他需要對應的表中，必須是選擇區域的第一列，如下面所示：
目標基因的信息提供的是gene name，需要調取的是基因的ID，
對應的注釋表格，應該將name放到需要的信息gene id的前面才可以使用。
