派森諾NovaSeq SP芯片PE250實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)來(lái)襲！！！
2019-07-08
Illumina 公司推出的NovaSeq 6000 SP芯片，其更高的測(cè)序通量及更短的測(cè)序周期都使得它能夠在眾多測(cè)序平臺(tái)中脫穎而出，尤其是PE250測(cè)序策略的推出，讓我們?cè)跀U(kuò)增子測(cè)序領(lǐng)域中看到了更廣闊的前景！
派森諾依靠強(qiáng)大的技術(shù)研發(fā)實(shí)力，和開(kāi)拓進(jìn)取的精神，目前已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了菌群多樣性組成譜項(xiàng)目的NovaSeq SP芯片PE250測(cè)序！接下來(lái)小編按捺不住激動(dòng)的心情，向大家展示派森諾NovaSeq SP芯片PE250實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)及分析結(jié)果，讓我們一睹為快吧~
本次數(shù)據(jù)與MiSeq PE250數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比，總結(jié)為以下幾點(diǎn)：
NovaSeq細(xì)菌16S rRNA基因堿基質(zhì)量分布圖
NovaSeq真菌ITS1基因堿基質(zhì)量分布圖
細(xì)菌16S rRNA基因與真菌ITS1基因NovaSeq測(cè)序質(zhì)量表格
從以上數(shù)據(jù)圖表可以發(fā)現(xiàn)，NovaSeq PE250測(cè)序數(shù)據(jù)通量和質(zhì)量都高出一大截，堿基質(zhì)量Q30平均可以達(dá)到90%以上，遠(yuǎn)高出官方提供標(biāo)準(zhǔn)，數(shù)據(jù)利用率進(jìn)一步提升；
MiSeq與NovaSeq細(xì)菌16S rRNA基因門(mén)和屬水平物種相對(duì)豐度柱形圖
MiSeq與NovaSeq真菌ITS1基因門(mén)和屬水平物種相對(duì)豐度柱形圖
無(wú)論是細(xì)菌還是真菌測(cè)序分析結(jié)果，都可以看出，兩種測(cè)序平臺(tái)得到的物種組成及豐度分布保持高度一致，優(yōu)勢(shì)物種分布無(wú)差別；
MiSeq與NovaSeq稀有物種（<0.1%）數(shù)量對(duì)比
在隨機(jī)挑選的8個(gè)樣品中，我們針對(duì)樣品中屬水平上的稀有物種（即相對(duì)豐度低于0.1%）進(jìn)行了數(shù)量統(tǒng)計(jì)，結(jié)果顯示，NovaSeq測(cè)序得到的結(jié)果能獲得更多的稀有物種，這對(duì)于我們研究關(guān)鍵物種意義重大，也展現(xiàn)了NovaSeq測(cè)序平臺(tái)更大數(shù)據(jù)規(guī)模測(cè)序的優(yōu)勢(shì)！
MiSeq與NovaSeq的Procrustes一致性比較分析
同時(shí)，Beta多樣性Procrustes一致性分析結(jié)果顯示，兩種測(cè)序平臺(tái)的同一樣品物種組成及豐度分布基本一致，且高度相關(guān)。
上述結(jié)果表明，作為Illumina測(cè)序系統(tǒng)中的“新貴”，NovaSeq平臺(tái)不僅能獲得和MiSeq平臺(tái)高度一致的菌群組成結(jié)構(gòu)，而且在測(cè)序質(zhì)量上，也相比Q30>75%的MiSeq、NovaSeq PE250模式官方質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)，有大幅提升！更重要的是，在NovaSeq平臺(tái)上，能輕而易舉的實(shí)現(xiàn)大樣品量、高測(cè)序量的菌群多樣性組成譜解析，對(duì)于低豐度物種的探測(cè)、以及菌群整體組成的分辨率也將更精細(xì)！
派森諾也將一如既往地秉承“解析基因序列，詮釋生命密碼，改善人類(lèi)生活”的使命，始終貫徹“枝源派本，一諾千金”的服務(wù)宗旨，繼續(xù)為大家?guī)?lái)科研技術(shù)服務(wù)！
