2019-01-22
多組學（Multi-omics）研究是探究生物系統中多種物質之間相互作用的方法，包括基因組學、表觀基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學、微生物組學等，這些物質共同影響生命系統的表型、性狀等。隨著高通量測序技術的發展，組學（Omics）研究不斷深入，通過對各組學進行高通量測序并對數據整合研究，可以全面和系統地了解基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發等領域中多種物質的相互關系。為網絡生物學、系統生物學的研究提供重要的技術手段。
為便于對多組學研究思路的理解，我們將近期發表的多組學文章進行整理。
1 、Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome
基因組、外顯子組、轉錄組測序在臨床癌癥基因組學中的研究
期刊：Nature Communications
影響因子：12.353
發表時間：2018
研究思路：對78例臨床腫瘤樣本，通過基因組、外顯子組、轉錄組測序，對基因結構進行研究，找到與腫瘤相關的結構變異（structure variation,SV）、體細胞突變、致病性突變等。
2 、Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms
微生物次生代謝產物生物合成的多組學研究
期刊：Current Opinion in Microbiology
影響因子：6.710
發表時間：2018
研究思路：利用基因組學、轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學的方法，開發天然代謝產物。基因組學，挖掘天然產物的生物合成基因；轉錄組學，代謝通路分析；蛋白質組學，代謝通路分析；代謝組學，代謝通路分析、天然產物新家族的發現。具體研究思路見下圖。
3 、Multi-omics approaches to disease
疾病的多組學研究方法
期刊：Genome Biology
影響因子：13.214
發表時間：2017
研究思路：本文為綜述類文章，闡述多組學在疾病中的研究思路，包括基因組、表觀基因組、轉錄組、蛋白質組、代謝組、微生物組學的整合及各組學的相互關系。除基因組外，其它的組學都反映了遺傳調控和環境的關系，這可能在不同程度上影響到每個組學的特定物質。各組之間會頻繁發生交互作用。此外，利用多組學研究，可對GWAS突變進行優先級排序。
以上是通過發表的文獻對多組學整合研究思路的梳理。后續，我們將陸續推出多組學研究案例的解讀，敬請期待。
