2018-12-04
文案 | 轉錄調控事業部
轉錄因子（Transcription factor，TF）也稱反式作用因子，是能夠直接或間接與基因的順式作用元件和RNA聚合酶結合以調控基因表達的一組雙鏈DNA結合蛋白。
圖1 轉錄因子主要結構
真核生物的RNA聚合酶不能直接識別啟動子，需要通過多個轉錄因子間接與DNA結合，形成專一復合物轉錄相應的基因。轉錄因子通過與基因5`端上游特定序列專一性結合，從而保證目的基因以特定的強度、時間、空間進行表達。
圖2：轉錄起始前復合物
轉錄因子的研究已經成為生物學領域研究熱點，不管是人類和動物的重大疾病，還是植物的抗病抗逆，都與轉錄因子息息相關。
下面與大家分享一些轉錄因子數據庫，幫助我們實現轉錄因子的查找，結構預測，結合位點以及靶基因預測等需求。
植物轉錄因子數據庫
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
?
http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v2.0/
擬南芥轉庫因子數據庫
http://urgv.evry.inra.fr/CATdb
動物轉錄因子數據庫
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB#!/species
人與鼠轉錄因子數據庫
http://hocomoco11.autosome.ru/mouse/mono?full=fals
預測轉錄因子結合位點數據庫
JASPAR: http://jaspar.genereg.net/
PROMO: http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3
Matinspector:http://www.genomatix.de/online_help/help_matinspector/matinspector_help.html
轉錄因子靶基因預測數據庫
MEME：http://meme-suite.org/tools/fimo
hTFtarget database：http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget#!/
有這些強大的數據庫助力，要做轉錄因子研究的你，不妨試一試，發掘它們的強大功能吧！
